V oblasti ochrany a racionálneho využívania vôd spoločnosť vykonáva:
- vyhotovenie a zabezpečenie schválenia Plánu preventívnych opatrení (havaríjný plán) v súlade so zákonom o vodách a vykonávacím predpisom,
- školenia zamestnancov zaradených do činností pri zneškodňovaní mimoriadneho zhoršenia vôd,
- vypracovanie a aktualizovanie prevádzkových poriadkov, plánov údržby, opráv a plánov kontroly,
- zabezpečenie funkcie vodohospodára s výkonom jeho povinností v súlade so zákonom o vodách.